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纳米孔测序中几个要害题目的机械进修和算法研讨

公布日期:     作者:      编纂:潘懿     点击:

讲演问题:纳米孔测序中几个要害题目的机械进修和算法研讨

报告人: 高欣博士 沙特阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)副教授、KAUST盘算生物学中央的研究员

讲演工夫:2018年7月4日(周三)下昼14:00

讲演所在:吉林大学北校区计算机大楼A521讲学厅

主办单位:计算机科学取技术学院

 

讲演择要:

纳米孔测序是一种最新的第三代测序手艺。它具有单份子测序,便携式,长读长等奇特长处。但同时,它也具有种种手艺瓶颈带来的低测序精度等致命瑕玷。从数据剖析的角度来讲,纳米孔测序需求把工夫序列的超长电流旌旗灯号解码成响应的DNA序列。正在此次讲演中,我将引见我的课题组近期正在纳米孔测序的几个要害题目上的深度学习方法和算法设想方面的事情。包孕我们研发的基于深度进修的碱基辨认的要领,WaveNano,第一个电流层面的旌旗灯号模拟器,DeepSimulator,和一个精准并快速的长读长的联配算法,cwDTW。

 

报告人简介:

高欣博士于2004年正在清华大学计算机系得到学士学位,2009年正在加拿大滑铁卢大学计算机学院得到博士学位。2009年10月至2010年9月,正在美国卡耐基梅隆大学计算机学院雷恩盘算生物学中央担负雷恩学者。2010年10月,任沙特阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)计算机,电子取数学科学取技术学院助理传授。2016年7月提升为副教授,并担负KAUST盘算生物学中央的研究员、加拿大滑铁卢大学计算机学院的客座教授。

科研偏向是生物信息学和机械进修。重要事情集中正在机械进修的实际和要领的研发,生物信息学,和两者的交织范畴。特别致力于构建盘算模子,设想高效的算法,并研发机械学习方法去处理构造生物学,体系生物学,和分解生物学中的开放题目。停止现在,正在生物信息范畴和机械进修范畴宣布了凌驾140篇学术论文。

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